Закрыть кнопку

Выберите свой региональный сайт

Закрыто

Исследование химического обмена методом 2D ЯМР

НМ200003E

ЯМР-сигнал спина отражает его локальное магнитное окружение. Если спин, вызванный химическим обменом, является образцом двух магнитно различных состояний, то его ЯМР-сигнал будет отражать оба состояния. Его появление в спектре ЯМР будет определяться динамикой события обмена. В случае медленного по шкале времени ЯМР химического обмена можно наблюдать два различных сигнала для одного и того же спина, по одному сигналу для каждого обмениваемого состояния. Наличие химического обмена часто демонстрируется обменным экспериментом (эксперимент 2D NOESY). Пик обмена (поперечный пик) одного и того же знака можно наблюдать между двумя автопиками (диагональными пиками), которые представляют два состояния при обмене. Поскольку одни и те же результаты можно интерпретировать по-разному на основе NOE, желательны дополнительные доказательства.
Обменный эксперимент ZZ представляет собой двухмерный ЯМР-эксперимент для количественного изучения медленного химического обмена в белках. Первоначально сообщалось, что 1H15N HSQC, который использует в качестве зонда ЯМР относительно изолированный 1H15N-спиновая система в пептидной связи равномерно 15N-меченые белки. А 1H13Вариант C HSQC вышеописанного эксперимента был подготовлен и испытан на небольшом соединении.

Эксперимент по обмену ZZ

Из-за частичного характера двойной связи амидной связи CN в N,N-диметилформамиде (ДМФА) свободное вращение вокруг CN затруднено, и может быть установлен медленный обмен между двумя различными сигналами метильных протонов (состояния A и B). Кросс-пики (обменные пики) с той же фазой, что и диагональные пики, можно наблюдать в экспериментах 2D NOESY и 2D ROESY (рис.1). 

Рис. 1: 2D NOESY (слева) и 2D ROESY (справа) ДМФА в ДМСО-d6 при 70°C.

Рис. 1: 2D NOESY (слева) и 2D ROESY (справа) ДМФ в ДМСО-d6 при 70 ° С.

Эта система медленного обмена была дополнительно исследована с помощью недавно подготовленного эксперимента по обмену ZZ. Вкратце, в 1H13C ZZ обменный эксперимент, следующий 13C частотная маркировка во время t1 (косвенное измерение), намагниченность меняется в фазе 13CZ намагничивание и допускается к обмену. Затем намагниченность передается протону и маркируется его частотой протона во время FID (прямое измерение) (рис.2).

Рис. 2: эксперимент по обмену 1H13C ZZ.

Рис. 2: 1H13Эксперимент по обмену C ZZ.

Результаты с ДМФА показаны на рис.3 для разных значений времени перемешивания. Пики обмена наблюдались между двумя 1H-13C перекрестные пики (автопики), представляющие два состояния обмена. Автопики представляют собой намагниченность, которая не изменилась во время смешивания. Обменный пик, обозначенный как B->A на рис.3, представляет собой намагниченность B в начале ZZ-обмена (помечена частотой углерода B в течение t1), который был заменен во время смешивания и, следовательно, был переведен в состояние A (помеченное частотой протона A в течение t2). Точно так же пик обмена A-> B представляет собой намагниченность углерода в состоянии A, которая была переведена в состояние B и помечена частотой протона B.

Рис. 3: Эксперимент по обмену 1H13C ZZ на ДМФ в ДМСО-d6. 2D-эксперимент был выполнен как измерение массива для параметра сбора «время смешивания». Результатом является один файл псевдо-3D данных с записанными значениями времени смешивания по оси Z.

Рис. 3: 1H13Эксперимент по обмену C ZZ на ДМФ в ДМСО-d6. 2D-эксперимент был выполнен как измерение массива для параметра сбора «время смешивания». Результатом является один файл псевдо-3D данных с записанными значениями времени смешивания по оси Z.

Фазовый цикл в сочетании с развязкой протонов и намагничиванием углерода в фазе во время перемешивания гарантирует отсутствие вклада NOE в обменные пики. Следовательно, приведенный выше эксперимент может подтвердить наличие медленного обмена или даже дать при благоприятных условиях количественное описание обменного события.

В приведенном выше эксперименте необходимо, чтобы обменные состояния А и В демонстрировали разные химические сдвиги как для протона, так и для углерода. Если это не так, то обменные пики будут накладываться на автопики. В особом случае, когда состояния обмена показывают один и тот же протон, но разные химические сдвиги углерода, обмен можно продемонстрировать с помощью 13C-13C NOESY тип эксперимента (рис.4).

Рис. 4: 13C-13C NOESY для ДМФ в ДМСО-d6 при 70oC.

Рис. 4: 13C-13C NOESY для ДМФ в ДМСО-d6 при 70 ° С.

Референции

Дж Биомол ЯМР, 4, 727-734, 1994

консоль

JNM-ECZ400S, JNM-ECZ600R+ROYALPROBE™

Дополнительную информацию см. в файле PDF.
Другое окно открывается при нажатии.

PDF 881KB

Решения по областям применения

Закрыто
Уведомление

Вы медицинский работник или персонал, занимающийся медицинским обслуживанием?

Нет

Напоминаем, что эти страницы не предназначены для предоставления широкой публике информации о продуктах.

Основы инструментов JEOL

Простое объяснение механизмов и
применения продуктов JEOL

Контакты

JEOL предлагает широкий ряд услуг по техническому обслуживанию и ремонту, чтобы наши клиенты могли спокойно и осознанно работать с оборудованием.
Мы ждем ваших запросов!